台北國稅局表示，不同於房地合一稅，企業出售適用舊制的房地時，土地部分不會課所得稅，但相對而言，相關成本費用支出，列報後也不能抵減應稅所得。

官員指出，營利事業的各項合理收支，能歸屬者都應明確歸屬，譬如出售不動產時，土地部分的成本，就應該要依出售所得的屬性，認定為舊制或房地合一稅的出售所得。若出售適用舊制土地，由於免納所得稅，因此可合理明確歸屬的成本、費用、利息及損失，雖然都應列報於當年度免稅收入項下，但不能減除應稅所得。

官員指出，現在大部分企業名下的土地，是在2016年1月1日之後取得的，其交易所得要依房地合一稅規定課稅；除此之外的老舊房地，才是依舊制規定免納所得稅，但相關成本、費用或損失的部分，通常就不能減除應稅收入，呼籲營利事業在計算出售土地利益及損失時，應留意土地取得時間點。